佐世保市は、軍港設置とともに急速に発展し人の流入も増加。相当数存在していたカトリック信徒の為、1899年に佐世保教会という名称で、谷郷町に設立されました。その後更に信者の急増に伴い、1931年により大きな現在の教会が完成。美しいゴシック建築ですが、設計者、施工者共に不明。太平洋戦時下においては、異教として軍部の圧迫を受け、空襲の目標になりにくい様に黒く塗られ、戦火から免れた大変貴重な教会です。