長崎市五島町の福岡藩御用達の商家である萬屋に生まれた古賀十二郎。長崎市立商業学校から東京外国語学校に進み、広島で3年間英語教師として教鞭をとりました。その後長崎に戻り、長崎史談会を創設。長崎における歴史の基礎を築きます。そして大正8年、長崎市史編纂の参与となる編纂主任として、いわゆる「長崎学」の礎を築きました。また明治45年の長崎県立図書館創設にも尽力。洋書収集ではオランダとの交渉役を務めました。