明治25年、九州鉄道会社は長崎-佐世保間の鉄道敷設を始めますが、不況によって中止してしまいます。明治28年になると再度着工し、明治30年に長崎-長与間、翌31年には佐世保-早岐-大村-長与間が開通。最初の頃、長崎駅は現在の浦上駅の位置にありました。明治38年の路線延長によって現在の位置に長崎駅が置かれて、長崎駅だった場所を新たに浦上駅と改称しました。